1990年至今，我國在改革開放不同時期，根據外向型經濟發展需要，先后設立了保稅區、出口加工區、保稅物流園區、保稅港區、綜合保稅區和跨境工業區等6種類型海關特殊監管區域。
江蘇省的海關特殊監管區域起步于20世紀90年代初，歷經全國首家內河港型保稅區、全國首家出口加工區以及全國首家綜合保稅區的變遷。可以說，江蘇省的海關特殊監管區域發展見證了全國海關特殊監管區域的發展歷程。
“敢為天下先”——設立全國首家出口加工區
2000年9月6日，全國首家出口加工區——昆山出口加工區通過海關總署等9部委聯合驗收，我國歷史上第一個出口加工區自此誕生，揭開了海關特殊監管區域發展的新篇章。
時間進入20世紀90年代中葉，國際電子信息產業轉移，國際產業資本加速流動，一個新的發展機遇展示在人們的面前；而當時又正值東南亞金融危機來勢洶涌，國家對外企稅收等政策作了調整，吸引外資面臨著嚴峻的挑戰。
為承接國際電子信息等制造業產能轉移，助力企業享受更優惠的稅收政策，南京海關所屬昆山海關借鑒臺灣新竹加工出口區，積極爭取設立出口加工區試點。
2000年4月27日，國務院正式發文批準設立15個出口加工區為全國的試點，昆山作為唯一的縣（處）級單位，名列其中。國務院批文下達后，昆山一鼓作氣，在短時間內高標準完成了各項基礎設施和海關監管設施建設，創造了昆山速度。
2000年l0月8日，昆山出口加工區正式封關運作。昆山出口加工區設立當年，就拉動外資投產4.2億美元，通關效率提升10倍以上，企業生產實現“零庫存”，成為全國出口加工區的“樣板間”。全國第一票網上報關、全國首批深加工結轉試點、全國首家拓展保稅物流功能……一項項全國、全省首創改革在昆山出口加工區誕生，時任國務院總理溫家寶、國務委員吳儀視察時均給予高度肯定。
2009年12月，昆山出口加工區升級為綜合保稅區，功能更齊全、監管更高效、改革更多元：全國第一票跨關區分送集報、全國第一家海關特殊監管區域一般納稅人資格試點、全國第一票全球維修貨物……
“功能整合優化”——設立全國首家綜合保稅區
蘇州工業園區也是2000年獲批全國首批出口加工區的試點之一。
蘇州工業園區地處長三角腹地，被譽為“中國開放的重要窗口”和“國際合作的成功范例”，外向型經濟非常發達。早在2000年，蘇州工業園區即獲批全國首批出口加工區試點；2004年，全國首家“海關保稅物流中心（b型）”在蘇州工業園區進行試點。依托出口加工區等海關特殊監管區域，蘇州工業園區的保稅加工和保稅物流業務迅速增長。
盡管各項數字看好，可土地有限、商務成本日漸增高，下一步的發展空間如何拓展？區域競爭力如何凸顯？此外，蘇州工業園區擁有出口加工區a區、b區、全國首家保稅物流中心（b型）、內陸直通式監管點，相互之間功能分割，政策交叉重疊、貨物流轉不便，導致企業產業鏈與供應鏈的配套受到影響。如何整合各個區域的功能政策，使其進一步適應區域經濟增長的需要，推動區域經濟在更高平臺上實現轉型升級，成為當時的蘇州工業園區海關最為關注的問題。
2006年12月國務院批復蘇州工業園區成立綜合保稅區，比照上海洋山保稅港享受有關外匯和稅收政策，原出口加工區a區、b區、全國首家保稅物流中心（b型）、唯亭海關監管點，實現三區合一、信息聯網、政策疊加。自此中國內陸首個沒有港口的保稅港區誕生。
綜合保稅區應改革開放而生、隨改革開放而興，集保稅區、出口加工區、保稅物流區等功能于一體，目前是我國開放型功能最齊全的海關特殊監管區域。目前的蘇州工業園綜合保稅區與初期相比，從純粹的保稅加工制造到保稅物流、保稅貿易與保稅倉儲，更是增添了保稅維修檢測、保稅研發、保稅展示交易等新興功能。10余年的發展，政策功能在拓展，區域性質在轉型，相關配套管理制度不斷革新。
目前，除了張家港保稅港區外，江蘇原有的各類海關特殊監管區域都已轉型為綜合保稅區。名稱變化的背后，折射出企業需求和升級之變。
“轉型升級在路上”——新時代的海關特殊監管區域
伴隨著我國與世界經濟的深度融合，國內外經濟形勢的深刻變化，綜合保稅區等海關特殊監管區域出口導向的發展定位和配套政策制度已無法適應當前的發展需求。綜合保稅區需要從“以外為主”向“內外兼容”轉型升級，更好地服務國際國內兩個市場，統籌利用國際國內兩種資源，成為綜合保稅區發展的必由路徑。
2014年9月國務院同意蘇州工業園綜合保稅區、重慶兩路寸灘保稅港區開展貿易多元化試點，符合條件的貿易功能區內企業將獲得增值稅一般納稅人資格。
2016年11月，蘇州工業園綜合保稅區、昆山綜合保稅區全國首批開始增值稅一般納稅人資格試點。試點企業內銷、購入區外貨物分別可開具、索取增值稅專用發票，享受抵扣增值稅進項稅、出口退稅等政策優惠。試點企業三星電子家電（蘇州）有限公司平均每票貨物出入區時間節約了95%，該公司和國內供應商在報關方面的人力和資金投入每年降低近300萬元。
2019年1月，《國務院關于促進綜合保稅區高水平開放高質量發展的若干意見》（以下簡稱《意見》）明確要求：賦予綜合保稅區改革開放新使命，打造具有國際競爭力和創新力的海關特殊監管區域。
2019年8月，國務院批復同意設立中國（江蘇）自由貿易試驗區，成為江蘇省建設新時代改革開放新高地、服務全國發展大局新平臺的重要標志。政策疊加，海關特殊監管區域迎來轉型升級發展的新時代。
南京海關將落實國務院《意見》作為2019年度5項重要任務之一，推動召開省政府工作推進會，將其列入江蘇年度“十大百項”重點任務；參與制定總署操作規程12部，優化信息系統和業務環節23個；攜手各地開展政策宣講會近20場、參訓人員2000余人次，通過新媒體精準推送政策解讀100余篇次，為1000余家區內外企業開展“送政策上門”。截至目前，國務院21項措施中已有15項在江蘇省落地，區內注冊企業同比增長7.1%，活躍企業數居全國第一；一般納稅人試點成效居全國首位。
現在，江蘇省是全國綜合保稅區最為集中的省份之一，共有海關特殊監管區域21個，包括1個保稅港區和20個綜合保稅區。2021年上半年，海關特殊監管區域平均每平方公里實現進出境貨值9億美元，實現了“小區域、大產出”的巨大作用。（王嬌龍、顧魯/文）
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